Susanne Kaser ist stellvertretende Klinikdirektorin der Universitätsklinik für Innere Medizin I sowie Universitätsprofessorin für Endokrinologie und Diabetologie. Darüber hinaus leitet sie das Erweiterungsstudium Klinische Ernährungs- und Präventivmedizin.
Ihre wissenschaftlichen Schwerpunkte liegen insbesondere in den Bereichen Diabetes mellitus, Insulinresistenz, Lipidstoffwechselstörungen, ernährungsmedizinische Fragestellungen sowie Fettlebererkrankungen (Metabolic Dysfunction-Associated Steatotic Liver Disease (MASLD)).
Ab 2015 leitete sie ein Christian-Doppler-Forschungslabor mit Fokus auf Insulinresistenz und Ernährung.
Von 2020 bis 2021 war Susanne Kaser Präsidentin der Österreichischen Diabetesgesellschaft (ÖDG). Seit 2023 ist sie Mitglied des Clinical Committee der European Society of Endocrinology (ESE). Ab 2027 übernimmt sie für zwei Jahre die Präsidentschaft der Österreichischen Gesellschaft für Endokrinologie und Stoffwechsel (ÖGES).
Zudem ist sie als EBEEDM Board Member mitverantwortlich für die europäischen Facharztprüfung im Bereich Endokrinologie, Diabetes und Stoffwechsel. Im Jahr 2026 wurde Susanne Kaser als Mitglied in die Europäische Akademie der Wissenschaften und Künste (EASA) aufgenommen.