Markus Pirklbauer absolvierte das Studium der Humanmedizin sowie das Clinical-PhD-Studium an der Medizinischen Universität Innsbruck (Promotion sub auspiciis praesidentis). Nach seiner Facharztausbildung für Innere Medizin und Nephrologie an der Innsbrucker Univ.-Klinik für Innere Medizin IV ist er dort seit 2017 als leitender Oberarzt tätig und forscht als Assoziierter Professor an der Medizinischen Universität Innsbruck. Seine wissenschaftlichen Schwerpunkte sind die Präzisionsmedizin bei chronischer Nierenerkrankung (Schwerpunkt diabetische Nierenerkrankung) sowie Mineral- und Knochenstoffwechselstörungen bei HämodialysepatientInnen. Seine Forschungstätigkeit wurde mehrfach durch den Jubiläumsfonds der Österreichischen Nationalbank sowie den Fond zur Förderung der wissenschaftlichen Forschung (FWF) gefördert und von der Europäischen und Österreichischen Gesellschaft für Nephrologie sowie dem Österreichischen Bundesministerium für Bildung, Wissenschaft und Forschung ausgezeichnet.